Un proyecto militar secreto pone en peligro a Neo-Tokyo tras convertir a un miembro de una banda de motociclistas en un psicópata con poderes psíquicos al que solo podrán detener dos adolescentes y un grupo de psíquicos.
Un niño de cinco años desarrolla una relación con Ponyo, una princesa de las profundidades marinas que desea convertirse en humana tras enamorarse de él.