Manny, Sid e Diego scoprono che l'era glaciale sta per finire e si uniscono a tutti per un viaggio verso un livello più elevato. Durante il viaggio, scoprono che Manny, in realtà, non è l'ultimo dei mammut.
Quando Sid viene rapito da una madre di dinosauro dopo aver provato ad adottare le sue tre uova, si perde in un mondo sotterraneo e i suoi amici tentano di salvarlo.
Manny, Diego e Sid si imbarcano in un'altra avventura dopo che il loro continente è alla deriva. Usando un iceberg come una nave, incontrano creature marine e combattono i pirati mentre esplorano un nuovo mondo.